但是，他的这一做法，激起了1227年担任教皇的格里高利九世的愤怒。教皇公开谴责腓特烈公然与异教徒签约，并对他施加“绝罚”——开除教籍，断绝往来，受罚者死后不能升天。
不仅如此，教皇还组织护教军，攻打腓特烈二世的出生地——西西里岛。
由此，神圣罗马帝国皇帝腓特烈二世与教皇格里高利九世反目成仇，双方相互拆台的小动作不断。腓特烈二世所做的小动作之一，就是暗地里支援“异教徒”，包括已经濒临绝境的清洁派。
查理·奥托，这位名不见经传的人物，从日记描述中的语气推测，似乎是腓特烈二世的侍从官。在他的日记中，记录下这些对于教廷而言绝对是不可饶恕的叛逆事件。
同时，他还在日记中怀疑，腓特烈二世之所以暗中支持清洁派，不仅仅是给罗马教廷添乱，更是为了清洁派所珍藏的“圣杯”与宝藏。
日记中，记录了一件对于查找清洁派宝藏非常重要的事情。
1229年，腓特烈二世与教皇军队，在西西里岛交战正酣，支持清洁派的朗科多（法国南部的一个省份）亲王，与清洁派当时的主教鲁西昂，曾经携带圣杯秘密拜见腓特烈二世，祈求庇护。
在奥托的日记中，对圣杯有着非常准确的描述：通体为纯金所制，圆形底托上，镶嵌着28颗珍珠、2块红宝石和2块绿宝石，杯底嫣红；含底托的高度约为三分之一腕尺——腕尺是古希腊和罗马的长度单位，指的是从指间到肘的距离，约合45厘米。
但不知为何，腓特烈二世并没有收下圣杯，反而放走了两人。
腓特烈二世的这种行为被奥托认为，神圣帝国皇帝想要从教义上给罗马教廷制造更大的麻烦，因为当时遭受教廷压迫的不仅仅是清洁派，还有亚当派、圣像破坏派、祷告派等反对教廷的教派，皇帝希望他们能团结起来，因而，放走唾手可得的“圣杯”。
但是，1230年，腓特烈二世的军队，战胜护教军，罗马教廷教皇格里高利九世不得不低头认输，解除对皇帝的“绝罚”，双方关系有所缓和。
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